MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.05

Total Repeats: 743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019741	AGT	2	6	190	195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019741	AGT	2	6	241	246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314671
3	NC_019741	GGTA	2	8	277	284	25 %	25 %	50 %	0 %	428314671
4	NC_019741	CAA	2	6	311	316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314671
5	NC_019741	GGT	2	6	367	372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314671
6	NC_019741	GGGA	2	8	382	389	25 %	0 %	75 %	0 %	428314671
7	NC_019741	AGGACA	2	12	429	440	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428314671
8	NC_019741	CAAAA	2	10	494	503	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019741	A	6	6	500	505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019741	GAA	2	6	583	588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019741	GTA	2	6	625	630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019741	TAC	2	6	641	646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019741	CATG	2	8	650	657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019741	CTC	2	6	690	695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019741	CT	3	6	697	702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019741	CGA	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019741	ATT	2	6	743	748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019741	CTT	2	6	752	757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019741	TTCC	2	8	856	863	0 %	50 %	0 %	50 %	428314672
20	NC_019741	GTT	2	6	874	879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314672
21	NC_019741	TCGC	2	8	968	975	0 %	25 %	25 %	50 %	428314672
22	NC_019741	CTGC	2	8	1029	1036	0 %	25 %	25 %	50 %	428314672
23	NC_019741	CTC	2	6	1044	1049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314672
24	NC_019741	TCT	2	6	1065	1070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314672
25	NC_019741	GTG	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314672
26	NC_019741	AGT	2	6	1333	1338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314672
27	NC_019741	CAA	2	6	1339	1344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314672
28	NC_019741	CCA	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314672
29	NC_019741	TGA	2	6	1379	1384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314672
30	NC_019741	CCA	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314672
31	NC_019741	GAC	2	6	1397	1402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314672
32	NC_019741	CT	3	6	1410	1415	0 %	50 %	0 %	50 %	428314672
33	NC_019741	TCA	2	6	1420	1425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314672
34	NC_019741	ACC	2	6	1485	1490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314672
35	NC_019741	T	7	7	1520	1526	0 %	100 %	0 %	0 %	428314672
36	NC_019741	T	7	7	1581	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	428314672
37	NC_019741	GCG	2	6	1588	1593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314672
38	NC_019741	CAA	2	6	1654	1659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314672
39	NC_019741	CATC	2	8	1714	1721	25 %	25 %	0 %	50 %	428314672
40	NC_019741	GCA	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314672
41	NC_019741	CGG	2	6	1780	1785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314672
42	NC_019741	TGC	3	9	1806	1814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314672
43	NC_019741	GATA	2	8	1816	1823	50 %	25 %	25 %	0 %	428314672
44	NC_019741	CGA	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314672
45	NC_019741	TGG	2	6	1930	1935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314672
46	NC_019741	CAG	2	6	1952	1957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314672
47	NC_019741	AGGA	2	8	2040	2047	50 %	0 %	50 %	0 %	428314672
48	NC_019741	GCGG	2	8	2117	2124	0 %	0 %	75 %	25 %	428314672
49	NC_019741	GCG	2	6	2142	2147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314672
50	NC_019741	CTGTT	2	10	2276	2285	0 %	60 %	20 %	20 %	428314672
51	NC_019741	CTG	2	6	2357	2362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314672
52	NC_019741	TTG	2	6	2363	2368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314672
53	NC_019741	GTTCA	2	10	2399	2408	20 %	40 %	20 %	20 %	428314672
54	NC_019741	CT	3	6	2419	2424	0 %	50 %	0 %	50 %	428314672
55	NC_019741	TGC	2	6	2434	2439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314672
56	NC_019741	TCA	2	6	2470	2475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314672
57	NC_019741	CCT	2	6	2500	2505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314672
58	NC_019741	AG	3	6	2531	2536	50 %	0 %	50 %	0 %	428314672
59	NC_019741	GAG	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314672
60	NC_019741	TCA	2	6	2709	2714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314672
61	NC_019741	ATG	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314672
62	NC_019741	AG	3	6	2801	2806	50 %	0 %	50 %	0 %	428314672
63	NC_019741	AAC	2	6	2811	2816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314672
64	NC_019741	TTC	2	6	2915	2920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314672
65	NC_019741	T	6	6	2985	2990	0 %	100 %	0 %	0 %	428314672
66	NC_019741	CTAG	2	8	3012	3019	25 %	25 %	25 %	25 %	428314672
67	NC_019741	AGTG	2	8	3041	3048	25 %	25 %	50 %	0 %	428314672
68	NC_019741	TGG	2	6	3102	3107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019741	ATAA	2	8	3119	3126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019741	CTTT	2	8	3131	3138	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019741	ACA	2	6	3171	3176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019741	ATA	2	6	3311	3316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314673
73	NC_019741	TGTT	2	8	3317	3324	0 %	75 %	25 %	0 %	428314673
74	NC_019741	ATT	2	6	3380	3385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314673
75	NC_019741	ATA	2	6	3413	3418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314673
76	NC_019741	GCCA	2	8	3561	3568	25 %	0 %	25 %	50 %	428314673
77	NC_019741	TGT	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314673
78	NC_019741	CA	3	6	3661	3666	50 %	0 %	0 %	50 %	428314673
79	NC_019741	CTG	2	6	3685	3690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314673
80	NC_019741	TCG	2	6	3747	3752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314673
81	NC_019741	TGAG	2	8	3771	3778	25 %	25 %	50 %	0 %	428314673
82	NC_019741	AGC	2	6	3813	3818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314673
83	NC_019741	AGC	2	6	3863	3868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314673
84	NC_019741	CAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314673
85	NC_019741	TCA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314673
86	NC_019741	TGC	2	6	3976	3981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314673
87	NC_019741	TCC	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314673
88	NC_019741	TC	3	6	4103	4108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019741	CAG	2	6	4124	4129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019741	AGC	2	6	4173	4178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019741	CAA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019741	AAT	2	6	4286	4291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019741	A	6	6	4297	4302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019741	TAG	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019741	GGC	2	6	4470	4475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314674
96	NC_019741	T	6	6	4585	4590	0 %	100 %	0 %	0 %	428314674
97	NC_019741	CCG	2	6	4615	4620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314674
98	NC_019741	CAA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314674
99	NC_019741	TC	3	6	4689	4694	0 %	50 %	0 %	50 %	428314674
100	NC_019741	CT	3	6	4760	4765	0 %	50 %	0 %	50 %	428314674
101	NC_019741	TGCCAG	2	12	4959	4970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428314674
102	NC_019741	TGC	2	6	5016	5021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314674
103	NC_019741	GCCA	2	8	5216	5223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019741	GGA	2	6	5232	5237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019741	TGA	2	6	5239	5244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019741	G	6	6	5250	5255	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019741	GGTTG	2	10	5378	5387	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019741	GCC	2	6	5411	5416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019741	CAA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019741	CT	3	6	5469	5474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019741	AGC	2	6	5545	5550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314675
112	NC_019741	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314675
113	NC_019741	CTT	2	6	5632	5637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314675
114	NC_019741	CTT	2	6	5759	5764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314675
115	NC_019741	TGT	2	6	5836	5841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314675
116	NC_019741	GCG	2	6	5861	5866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314675
117	NC_019741	G	6	6	5899	5904	0 %	0 %	100 %	0 %	428314675
118	NC_019741	GCT	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314675
119	NC_019741	ACT	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314675
120	NC_019741	AAG	2	6	6022	6027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314675
121	NC_019741	ATC	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314675
122	NC_019741	ACAT	2	8	6141	6148	50 %	25 %	0 %	25 %	428314675
123	NC_019741	ATT	2	6	6211	6216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314675
124	NC_019741	ATT	2	6	6223	6228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314675
125	NC_019741	CAG	2	6	6237	6242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314675
126	NC_019741	CTG	2	6	6340	6345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019741	CTG	2	6	6357	6362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019741	TA	3	6	6377	6382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019741	TAGA	2	8	6406	6413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019741	GTA	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314676
131	NC_019741	ATCT	2	8	6490	6497	25 %	50 %	0 %	25 %	428314676
132	NC_019741	CA	3	6	6539	6544	50 %	0 %	0 %	50 %	428314676
133	NC_019741	CG	3	6	6566	6571	0 %	0 %	50 %	50 %	428314676
134	NC_019741	ACC	2	6	6579	6584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314676
135	NC_019741	TG	3	6	6596	6601	0 %	50 %	50 %	0 %	428314676
136	NC_019741	ATG	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314676
137	NC_019741	CTG	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314676
138	NC_019741	GTC	2	6	6691	6696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314676
139	NC_019741	CGC	2	6	6772	6777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314676
140	NC_019741	ATC	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314676
141	NC_019741	GGC	2	6	6814	6819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314676
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269	NC_019741	TCC	2	6	13075	13080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314682
270	NC_019741	CCA	2	6	13109	13114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314682
271	NC_019741	T	8	8	13200	13207	0 %	100 %	0 %	0 %	428314682
272	NC_019741	AGC	2	6	13215	13220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314682
273	NC_019741	CTT	2	6	13227	13232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314682
274	NC_019741	TCCCT	2	10	13233	13242	0 %	40 %	0 %	60 %	428314682
275	NC_019741	T	6	6	13322	13327	0 %	100 %	0 %	0 %	428314682
276	NC_019741	TGTTT	2	10	13336	13345	0 %	80 %	20 %	0 %	428314682
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279	NC_019741	CTTT	2	8	13439	13446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
280	NC_019741	CAA	2	6	13470	13475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_019741	AAAAT	2	10	13584	13593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_019741	T	6	6	13603	13608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_019741	A	8	8	13615	13622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_019741	TAT	2	6	13659	13664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_019741	TTA	2	6	13674	13679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_019741	AACTC	2	10	13707	13716	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
287	NC_019741	CGCCCT	2	12	13758	13769	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	428314683
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289	NC_019741	GA	3	6	13819	13824	50 %	0 %	50 %	0 %	428314683
290	NC_019741	GGAG	2	8	13917	13924	25 %	0 %	75 %	0 %	428314683
291	NC_019741	ATCG	2	8	13939	13946	25 %	25 %	25 %	25 %	428314683
292	NC_019741	ACC	2	6	14007	14012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314683
293	NC_019741	CCT	2	6	14084	14089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
294	NC_019741	CCA	2	6	14096	14101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_019741	GGA	2	6	14188	14193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314684
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302	NC_019741	GCTC	2	8	14595	14602	0 %	25 %	25 %	50 %	428314684
303	NC_019741	TGC	2	6	14618	14623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314684
304	NC_019741	TG	3	6	14627	14632	0 %	50 %	50 %	0 %	428314684
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306	NC_019741	GTT	2	6	14698	14703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314684
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310	NC_019741	CTT	2	6	14805	14810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314684
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312	NC_019741	TAT	2	6	14895	14900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314684
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391	NC_019741	CAA	2	6	19616	19621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314687
392	NC_019741	GCC	2	6	19654	19659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314687
393	NC_019741	CAAC	2	8	19701	19708	50 %	0 %	0 %	50 %	428314687
394	NC_019741	TGC	2	6	19944	19949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314688
395	NC_019741	AGG	2	6	19973	19978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314688
396	NC_019741	CAT	2	6	20127	20132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314689
397	NC_019741	CCAAT	2	10	20182	20191	40 %	20 %	0 %	40 %	428314689
398	NC_019741	CGAG	2	8	20217	20224	25 %	0 %	50 %	25 %	428314689
399	NC_019741	ACG	2	6	20297	20302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314689
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401	NC_019741	TGG	2	6	20541	20546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314690
402	NC_019741	TGA	2	6	20591	20596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314690
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